Protein–RNA interactions for Protein: P61962

DCAF7, DDB1- and CUL4-associated factor 7, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF7P61962 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DCAF7P61962 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms