Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
HERVK_113P61574 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms