Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ERVK-21P61565 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms