Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ABCE1P61221 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ABCE1P61221 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms