Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EEFSECP57772 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EEFSECP57772 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms