Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP107P57740 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP107P57740 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP107P57740 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP107P57740 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP107P57740 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP107P57740 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NUP107P57740 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms