Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UBASH3AP57075 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UBASH3AP57075 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms