Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms