Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXA1P49639 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXA1P49639 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms