Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
NESP48681 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NESP48681 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NESP48681 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
NESP48681 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NESP48681 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NESP48681 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NESP48681 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NESP48681 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NESP48681 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NESP48681 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NESP48681 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NESP48681 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NESP48681 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NESP48681 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC32.39■■■□□ 2.77
NESP48681 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
NESP48681 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NESP48681 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms