Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CRATP43155 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CRATP43155 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CRATP43155 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CRATP43155 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CRATP43155 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CRATP43155 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms