Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GPC1P35052 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GPC1P35052 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GPC1P35052 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms