Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDC27P30260 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDC27P30260 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC27P30260 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC27P30260 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC27P30260 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDC27P30260 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDC27P30260 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDC27P30260 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDC27P30260 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms