Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB5P28074 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms