Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EPHA1P21709 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms