Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR1P18146 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR1P18146 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR1P18146 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR1P18146 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR1P18146 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
EGR1P18146 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
EGR1P18146 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms