Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GCFC2P16383 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GCFC2P16383 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms