Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEFHP12036 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEFHP12036 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEFHP12036 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NEFHP12036 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NEFHP12036 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NEFHP12036 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms