Protein–RNA interactions for Protein: P10092

CALCB, Calcitonin gene-related peptide 2, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCBP10092 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CALCBP10092 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CALCBP10092 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CALCBP10092 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms