Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SAA2P0DJI9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms