Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTMAP06454 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PTMAP06454 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PTMAP06454 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms