Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NSD2O96028 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSD2O96028 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSD2O96028 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSD2O96028 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSD2O96028 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NSD2O96028 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NSD2O96028 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSD2O96028 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms