Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG7O95352 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATG7O95352 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms