Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRPF3O43395 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF3O43395 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms