Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MEFVO15553 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MEFVO15553 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MEFVO15553 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MEFVO15553 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MEFVO15553 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MEFVO15553 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms