Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VGFO15240 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VGFO15240 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VGFO15240 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VGFO15240 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VGFO15240 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VGFO15240 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VGFO15240 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VGFO15240 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VGFO15240 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VGFO15240 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VGFO15240 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VGFO15240 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
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