Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP290O15078 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP290O15078 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CEP290O15078 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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