Protein–RNA interactions for Protein: O14558

HSPB6, Heat shock protein beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB6O14558 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HSPB6O14558 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms