Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms