Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E9PBE3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E9PBE3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E9PBE3 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E9PBE3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E9PBE3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E9PBE3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E9PBE3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E9PBE3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E9PBE3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
E9PBE3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms