Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A8MVJ9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A8MVJ9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A8MVJ9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms