Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
SRRM4A7MD48 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SRRM4A7MD48 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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