Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MEIS3P1A6NDR6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms