Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
A0A0U1RQF3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
A0A0U1RQF3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms