Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNX8Q9Y5X2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms