Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.64■□□□□ 0.74
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SH3BP1Q9Y3L3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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