Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZDHHC9Q9Y397 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC9Q9Y397 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC9Q9Y397 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC9Q9Y397 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC9Q9Y397 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC9Q9Y397 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC9Q9Y397 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC9Q9Y397 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
ZDHHC9Q9Y397 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms