Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RCAN3Q9UKA8 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RCAN3Q9UKA8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms