Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC88CQ9P219 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CCDC88CQ9P219 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms