Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TVP23BQ9NYZ1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms