Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MIS18AQ9NYP9 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms