Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DEPPQ9NTK1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms