Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS25

SPANXB1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXB1Q9NS25 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SPANXB1Q9NS25 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SPANXB1Q9NS25 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms