Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SNX15Q9NRS6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX15Q9NRS6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms