Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEC31BQ9NQW1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEC31BQ9NQW1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms