Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB90

RRAGC, Ras-related GTP-binding protein C, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRAGCQ9HB90 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RRAGCQ9HB90 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms