Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBPF3Q9H094 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NBPF3Q9H094 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms