Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C20orf27Q9GZN8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms