Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRNKL1Q9BZJ0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CRNKL1Q9BZJ0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms