Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP3Q9BWW4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP3Q9BWW4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms